В том же году поступил на Курсы луговодства при институте. А после их окончания, как один из лучших, по свидетельству профессора А.Дмитриева, был приглашен младшим специалистом в Беколовский питомник трав бывшей Московской губернии. Во ВНИИ кормов поступил в 1931 году старшим специалистом отдела селекции.

Работы Б.Овчинникова по вопросам классификации люцерны и географии оригинальны, интересны и ценны не только для люцерноводов, но и для всех специалистов по вопросам кормов. Наибольшее значение и практическую ценность имеют его работы по технике культуры люцерны на семена на неорошаемых землях юга Европейской территории страны. Он также проводил научные селекционные исследования с эспарцетом, отчасти с клевером и злаковыми травами.

Борис Федорович – инициатор опытной разработки вопросов агротехники семеноводства люцерны, ее «осеверения». Он является автором селекционной сеялочки для кормовых трав, применяющейся на некоторых селекционных станциях.

Б.Овчинников – не только ученый. Он еще и замечательный художник. В музее ВНИИ кормов сохранились его картины, альбомы рисунков и дружеских шаржей на сотрудников института и участников совещаний луговодов.